Los análisis que cuantifican y clasifican el riesgo de extinción de una especie en el territorio de un país o región, así como la publicación de listas rojas, constituyen herramientas fundamentales para la prevención y el manejo de la pérdida de biodiversidad en escalas subglobales. Si bien Colombia se puede considerar un referente regional en el desarrollo de este tipo de análisis (publicaciones 2002 y revaluación de aves y peces dulceacuícolas) son numerosos los desafíos que estos análisis aún deben enfrentar en el país que les permita incrementar la cobertura taxonómica, periodicidad de los procesos de evaluación, sostenibilidad en el tiempo, así como el impacto en la planeación y gestión de la conservación en Colombia. Este documento presenta una propuesta para crear, implementar y consolidar un Sistema Operativo de Análisis y Monitoreo del Riesgo de Extinción de la Fauna Silvestre en Colombia para abordar con mayor efectividad estos desafíos. Su construccion surge a partir de una investigacion que identificó avances y vacíos en Colombia en relación con otros países de América Latina y el mundo, así como las discusiones y recomendaciones de expertos en fauna de Suramérica. La propuesta plantea objetivos, lineamientos, instancias, actores, actividades y esquemas de trabajo relevantes para incrementar la rigurosidad, transparencia, periodicidad, sostenibilidad e impacto de los análisis de riesgo y los listados rojos de fauna en Colombia. El sistema presentado es preliminar y deberá tener una amplia consulta y discusión encaminada a ajustar un modelo definitivo de trabajo sobre este tema en el país.